Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc9a3G3X939 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms