Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim55G3X8Y1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms