Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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