Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms