Protein–RNA interactions for Protein: F6T1I5

H2-T10, Histocompatibility 2, T region locus 10, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T10F6T1I5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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H2-T10F6T1I5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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H2-T10F6T1I5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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H2-T10F6T1I5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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H2-T10F6T1I5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-T10F6T1I5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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