Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms