Protein–RNA interactions for Protein: F2Z403

Defa27, Defensin, alpha, 27, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa27F2Z403 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa27F2Z403 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms