Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TrdnE9Q9K5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms