Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms