Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms