Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1P8

Irf2bp2, Interferon regulatory factor 2-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2bp2E9Q1P8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Irf2bp2E9Q1P8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms