Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms