Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms