Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms