Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms