Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms