Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rdh8D3Z6W3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms