Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms