Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms