Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms