Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms