Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms