Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc8B2RUS7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms