Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
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Usf3B2RUQ2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Usf3B2RUQ2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms