Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms