Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms