Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik3B1AS29 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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