Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms