Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Skint4A7TZF3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skint4A7TZF3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skint4A7TZF3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skint4A7TZF3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skint4A7TZF3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skint4A7TZF3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skint4A7TZF3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms