Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gbp4A4UUI3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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