Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Atp8b5A3FIN4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Atp8b5A3FIN4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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