Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Lcn6A2AJB9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Lcn6A2AJB9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Lcn6A2AJB9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Lcn6A2AJB9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Lcn6A2AJB9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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