Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel3A2AHA7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms