Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms