Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms