Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pramef6A2A8M8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pramef6A2A8M8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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