Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms