Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hmg20bQ9Z104 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hmg20bQ9Z104 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hmg20bQ9Z104 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hmg20bQ9Z104 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hmg20bQ9Z104 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Hmg20bQ9Z104 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hmg20bQ9Z104 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hmg20bQ9Z104 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hmg20bQ9Z104 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hmg20bQ9Z104 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hmg20bQ9Z104 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hmg20bQ9Z104 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hmg20bQ9Z104 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hmg20bQ9Z104 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hmg20bQ9Z104 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hmg20bQ9Z104 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hmg20bQ9Z104 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hmg20bQ9Z104 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms