Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc2Q9R244 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc2Q9R244 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms