Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfwd2Q9R1A8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfwd2Q9R1A8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfwd2Q9R1A8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfwd2Q9R1A8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfwd2Q9R1A8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfwd2Q9R1A8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfwd2Q9R1A8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfwd2Q9R1A8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfwd2Q9R1A8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfwd2Q9R1A8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfwd2Q9R1A8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfwd2Q9R1A8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfwd2Q9R1A8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfwd2Q9R1A8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfwd2Q9R1A8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfwd2Q9R1A8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfwd2Q9R1A8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfwd2Q9R1A8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfwd2Q9R1A8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfwd2Q9R1A8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfwd2Q9R1A8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms