Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CtsjQ9R014 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtsjQ9R014 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms