Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ripk3Q9QZL0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ripk3Q9QZL0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ripk3Q9QZL0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ripk3Q9QZL0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ripk3Q9QZL0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ripk3Q9QZL0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ripk3Q9QZL0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ripk3Q9QZL0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ripk3Q9QZL0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ripk3Q9QZL0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ripk3Q9QZL0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ripk3Q9QZL0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ripk3Q9QZL0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ripk3Q9QZL0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ripk3Q9QZL0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ripk3Q9QZL0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ripk3Q9QZL0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ripk3Q9QZL0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ripk3Q9QZL0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ripk3Q9QZL0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ripk3Q9QZL0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ripk3Q9QZL0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ripk3Q9QZL0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ripk3Q9QZL0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ripk3Q9QZL0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ripk3Q9QZL0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ripk3Q9QZL0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ripk3Q9QZL0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ripk3Q9QZL0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ripk3Q9QZL0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ripk3Q9QZL0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ripk3Q9QZL0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ripk3Q9QZL0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ripk3Q9QZL0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ripk3Q9QZL0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ripk3Q9QZL0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ripk3Q9QZL0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ripk3Q9QZL0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ripk3Q9QZL0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ripk3Q9QZL0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ripk3Q9QZL0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ripk3Q9QZL0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ripk3Q9QZL0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ripk3Q9QZL0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ripk3Q9QZL0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ripk3Q9QZL0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms