Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Bcl11aQ9QYE3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Bcl11aQ9QYE3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Bcl11aQ9QYE3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Bcl11aQ9QYE3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Bcl11aQ9QYE3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Bcl11aQ9QYE3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bcl11aQ9QYE3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bcl11aQ9QYE3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bcl11aQ9QYE3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Bcl11aQ9QYE3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Bcl11aQ9QYE3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Bcl11aQ9QYE3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Bcl11aQ9QYE3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bcl11aQ9QYE3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bcl11aQ9QYE3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bcl11aQ9QYE3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bcl11aQ9QYE3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bcl11aQ9QYE3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bcl11aQ9QYE3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bcl11aQ9QYE3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bcl11aQ9QYE3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bcl11aQ9QYE3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Bcl11aQ9QYE3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Bcl11aQ9QYE3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Bcl11aQ9QYE3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Bcl11aQ9QYE3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Bcl11aQ9QYE3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Bcl11aQ9QYE3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Bcl11aQ9QYE3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Bcl11aQ9QYE3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms