Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hacd1Q9QY80 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hacd1Q9QY80 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hacd1Q9QY80 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms