Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcb11Q9QY30 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcb11Q9QY30 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Abcb11Q9QY30 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Abcb11Q9QY30 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcb11Q9QY30 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcb11Q9QY30 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcb11Q9QY30 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcb11Q9QY30 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcb11Q9QY30 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcb11Q9QY30 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcb11Q9QY30 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcb11Q9QY30 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcb11Q9QY30 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcb11Q9QY30 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcb11Q9QY30 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcb11Q9QY30 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcb11Q9QY30 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcb11Q9QY30 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcb11Q9QY30 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcb11Q9QY30 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcb11Q9QY30 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcb11Q9QY30 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcb11Q9QY30 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcb11Q9QY30 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcb11Q9QY30 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcb11Q9QY30 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105 ms