Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnip3Q9QXT8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnip3Q9QXT8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms