Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Homer2Q9QWW1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Homer2Q9QWW1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms