Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVP9

Ptk2b, Protein-tyrosine kinase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2bQ9QVP9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptk2bQ9QVP9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptk2bQ9QVP9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptk2bQ9QVP9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptk2bQ9QVP9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptk2bQ9QVP9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptk2bQ9QVP9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptk2bQ9QVP9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptk2bQ9QVP9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptk2bQ9QVP9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptk2bQ9QVP9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ptk2bQ9QVP9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptk2bQ9QVP9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms