Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM93

Arl6ip4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip4Q9JM93 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Arl6ip4Q9JM93 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Arl6ip4Q9JM93 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arl6ip4Q9JM93 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arl6ip4Q9JM93 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arl6ip4Q9JM93 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arl6ip4Q9JM93 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arl6ip4Q9JM93 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Arl6ip4Q9JM93 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arl6ip4Q9JM93 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arl6ip4Q9JM93 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arl6ip4Q9JM93 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arl6ip4Q9JM93 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arl6ip4Q9JM93 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arl6ip4Q9JM93 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arl6ip4Q9JM93 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Arl6ip4Q9JM93 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arl6ip4Q9JM93 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arl6ip4Q9JM93 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arl6ip4Q9JM93 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arl6ip4Q9JM93 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arl6ip4Q9JM93 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arl6ip4Q9JM93 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arl6ip4Q9JM93 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arl6ip4Q9JM93 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arl6ip4Q9JM93 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arl6ip4Q9JM93 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Arl6ip4Q9JM93 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arl6ip4Q9JM93 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arl6ip4Q9JM93 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arl6ip4Q9JM93 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arl6ip4Q9JM93 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arl6ip4Q9JM93 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arl6ip4Q9JM93 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arl6ip4Q9JM93 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arl6ip4Q9JM93 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arl6ip4Q9JM93 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arl6ip4Q9JM93 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arl6ip4Q9JM93 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arl6ip4Q9JM93 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arl6ip4Q9JM93 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arl6ip4Q9JM93 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arl6ip4Q9JM93 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arl6ip4Q9JM93 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arl6ip4Q9JM93 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Arl6ip4Q9JM93 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arl6ip4Q9JM93 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms