Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc4apQ9JLV2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc4apQ9JLV2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc4apQ9JLV2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc4apQ9JLV2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc4apQ9JLV2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc4apQ9JLV2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc4apQ9JLV2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc4apQ9JLV2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc4apQ9JLV2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc4apQ9JLV2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc4apQ9JLV2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc4apQ9JLV2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc4apQ9JLV2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc4apQ9JLV2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc4apQ9JLV2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc4apQ9JLV2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc4apQ9JLV2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc4apQ9JLV2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc4apQ9JLV2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc4apQ9JLV2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc4apQ9JLV2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc4apQ9JLV2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc4apQ9JLV2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc4apQ9JLV2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms